RBM14 inhibits the replication of porcine epidemic diarrhea virus by recruiting p62 to degrade nucleocapsid protein through the activation of autophagy and interferon pathway.

Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV) results in PED, which is an infectious intestinal disease with the representative features of diarrhea, vomiting, and dehydration. PEDV infects neonatal piglets, causing high mortality rates. Therefore, elucidating the interaction between the virus and host in preventing and controlling PEDV infection is of immense significance. We found a new antiviral function of the host protein, RNA-binding motif protein 14 (RBM14), which can inhibit PEDV replication via the activation of autophagy and interferon (IFN) signal pathways. We found that RBM14 can recruit cargo receptor p62 to degrade PEDV nucleocapsid (N) protein through the RBM14-p62-autophagosome pathway. Furthermore, RBM14 can also improve the antiviral ability of the hosts through interacting with mitochondrial antiviral signaling protein to induce IFN expression. These results highlight the novel mechanism underlying RBM14-induced viral restriction. This mechanism leads to the degradation of viral N protein via the autophagy pathway and upregulates IFN for inhibiting PEDV replication; thus, offering new ways for preventing and controlling PED.IMPORTANCEPorcine epidemic diarrhea virus (PEDV) is a vital reason for diarrhea in neonatal piglets, which causes high morbidity and mortality rates. There is currently no effective vaccine or drug to treat and prevent infection with the PEDV. During virus infection, the host inhibits virus replication through various antiviral factors, and at the same time, the virus antagonizes the host's antiviral reaction through its own encoded protein, thus completing the process of virus replication. Our study has revealed that the expression of RNA-binding motif protein 14 (RBM14) was downregulated in PEDV infection. We found that RBM14 can recruit cargo receptor p62 to degrade PEDV N protein via the RBM14-p62-autophagosome pathway and interacted with mitochondrial antiviral signaling protein and TRAF3 to activate the interferon signal pathway, resulting in the inhibition of PEDV replication.

Porcine deltacoronavirus nsp5 antagonizes type I interferon signaling by cleaving IFIT3.

Porcine deltacoronavirus (PDCoV) has caused enormous economic losses to the global pig industry. However, the immune escape mechanism of PDCoV remains to be fully clarified. Transcriptomic analysis revealed a high abundance of interferon (IFN)-induced protein with tetratricopeptide repeats 3 (IFIT3) transcripts after PDCoV infection, which initially implied a correlation between IFIT3 and PDCoV. Further studies showed that PDCoV nsp5 could antagonize the host type I interferon signaling pathway by cleaving IFIT3. We demonstrated that PDCoV nsp5 cleaved porcine IFIT3 (pIFIT3) at Gln-406. Similar cleavage of endogenous IFIT3 has also been observed in PDCoV-infected cells. The pIFIT3-Q406A mutant was resistant to nsp5-mediated cleavage and exhibited a greater ability to inhibit PDCoV infection than wild-type pIFIT3. Furthermore, we found that cleavage of IFIT3 is a common characteristic of nsp5 proteins of human coronaviruses, albeit not alphacoronavirus. This finding suggests that the cleavage of IFIT3 is an important mechanism by which PDCoV nsp5 antagonizes IFN signaling. Our study provides new insights into the mechanisms by which PDCoV antagonizes the host innate immune response.IMPORTANCEPorcine deltacoronavirus (PDCoV) is a potential emerging zoonotic pathogen, and studies on the prevalence and pathogenesis of PDCoV are ongoing. The main protease (nsp5) of PDCoV provides an excellent target for antivirals due to its essential and conserved function in the viral replication cycle. Previous studies have revealed that nsp5 of PDCoV antagonizes type I interferon (IFN) production by targeting the interferon-stimulated genes. Here, we provide the first demonstration that nsp5 of PDCoV antagonizes IFN signaling by cleaving IFIT3, which affects the IFN response after PDCoV infection. Our findings reveal that PDCoV nsp5 is an important interferon antagonist and enhance the understanding of immune evasion by deltacoronaviruses.

Gut microbiota-derived butyrate promotes coronavirus TGEV infection through impairing RIG-I-triggered local type I interferon responses via class I HDAC inhibition.

Gut microbiota-derived metabolites are important for the replication and pathogenesis of many viruses. However, the roles of bacterial metabolites in swine enteric coronavirus (SECoV) infection remain poorly understood. Recent studies show that SECoVs infection in vivo significantly alters the composition of short-chain fatty acids (SCFAs)-producing gut microbiota. This prompted us to investigate whether and how SCFAs impact SECoV infection. Employing alphacoronavirus transmissible gastroenteritis virus (TGEV), a major cause of diarrhea in piglets, as a model, we found that SCFAs, particularly butyrate, enhanced TGEV infection both in porcine intestinal epithelial cells and swine testicular (ST) cells at the late stage of viral infection. This effect depended on the inhibited productions of virus-induced type I interferon (IFN) and downstream antiviral IFN-stimulated genes (ISGs) by butyrate. Mechanistically, butyrate suppressed the expression of retinoic acid-inducible gene I (RIG-I), a key viral RNA sensor, and downstream mitochondrial antiviral-signaling (MAVS) aggregation, thereby impairing type I IFN responses and increasing TGEV replication. Using pharmacological and genetic approaches, we showed that butyrate inhibited RIG-I-induced type I IFN signaling by suppressing class I histone deacetylase (HDAC). In summary, we identified a novel mechanism where butyrate enhances TGEV infection by suppressing RIG-I-mediated type I IFN responses. Our findings highlight that gut microbiota-derived metabolites like butyrate can be exploited by SECoV to dampen innate antiviral immunity and establish infection in the intestine.IMPORTANCESwine enteric coronaviruses (SECoVs) infection in vivo alters the composition of short-chain fatty acids (SCFAs)-producing gut microbiota, but whether microbiota-derived SCFAs impact coronavirus gastrointestinal infection is largely unknown. Here, we demonstrated that SCFAs, particularly butyrate, substantially increased alphacoronavirus TGEV infection at the late stage of infection, without affecting viral attachment or internalization. Furthermore, enhancement of TGEV by butyrate depended on impeding virus-induced type I interferon (IFN) responses. Mechanistically, butyrate suppressed the cytoplasmic viral RNA sensor RIG-I expression and downstream type I IFN signaling activation by inhibiting class I HDAC, thereby promoting TGEV infection. Our work reveals novel functions of gut microbiota-derived SCFAs in enhancing enteric coronavirus infection by impairing RIG-I-dependent type I IFN responses. This implies that bacterial metabolites could be therapeutic targets against SECoV infection by modulating antiviral immunity in the intestine.

Vacunación contra el SARS-CoV-2 en pacientes pediátricos con epilepsia: experiencia de un centro terciario en Colombia / SARS-CoV-2 vaccination in paediatric patients with epilepsy: experience of a tertiary center in Colombia

Objetivo: El objetivo de este estudio es evaluar los efectos de la vacunación contra el SARS-CoV-2 sobre el patrón convulsivo en pacientes pediátricos con epilepsia que acudieron a nuestro centro terciario en la ciudad de Bogotá, Colombia. Pacientes y métodos: Se pidió a los niños con epilepsia que fueron tratados en nuestro centro y que habían recibido la vacuna contra el SARS-CoV-2 y a sus cuidadores que informaran de su experiencia después de la vacunación. Se documentaron la edad, el sexo, la edad de inicio de la epilepsia, la duración de la epilepsia, el tipo de epilepsia, la frecuencia de las convulsiones, el número de medicamentos, el tiempo transcurrido desde la última crisis, los esquemas de vacunación y las convulsiones dos semanas después de la vacunación. Resultados: Se incluyó a 101 pacientes con epilepsia (58%, hombres; y 42%, mujeres). La edad promedio fue de 11 años, el 73% tenía epilepsia focal, y el 27%, generalizada. Veintiuno cumplían los criterios para la epilepsia refractaria y 11 tenían antecedentes personales de convulsiones febriles. Cuarenta y siete pacientes habían sido vacunados con la vacuna de Sinovac; 41, con Pfizer; 12, con Moderna; y uno, con CoronaVac. Tres pacientes presentaron convulsiones 24 horas después de la aplicación de la vacuna sin una relación clara entre la vacunación y la frecuencia de las convulsiones, y un paciente requirió ingreso en el hospital por una convulsión prolongada. Conclusión: La vacunación contra el SARS-CoV-2 en pacientes pediátricos con epilepsia es segura. Aproximadamente el 3% de los pacientes con epilepsia podría eventualmente tener convulsiones en el período posterior a la vacunación.

Aim: The objective of this study is to evaluate effects of SARS-CoV-2 vaccination on seizure pattern in paediatric patients with epilepsy that attended our tertiary center in the city of Bogotá, Colombia. Patients and methods: Children with epilepsy who were treated at our center and have had SARS-CoV-2 vaccination and their caregivers were asked to report their experience following vaccination. We documented age, sex, age at onset of epilepsy, duration of epilepsy, epilepsy type, seizure frequency, number of medications, time from last crisis, vaccination schemes, and seizures two weeks after vaccination. Results: One hundred and one patients with epilepsy were included (58%, male; and 42%, female). The average age was 11 years, 73% had focal epilepsy, and 27%, generalized. Twenty-one fulfilled criteria for refractory epilepsy and 11 had a personal history of febrile seizures. Forty-seven patients had been vaccinated with Sinovac’s vaccine; 41 patients, with Pfizer’s; 12 patients, with Moderna’s; and one, with CoronaVac’s. Three patients presented seizures 24 hours after the application of the vaccine with no clear relation between vaccination and seizure frequency, and one patient required admission to the hospital for a prolonged seizure. Conclusion: Vaccination against SARS-CoV-2 in paediatric patients with epilepsy is safe. Approximately 3% of patients with epilepsy could eventually have seizures in the post-vaccination period.(AU)

A recombination-resistant genome for live attenuated and stable PEDV vaccines by engineering the transcriptional regulatory sequences.

IMPORTANCE: Coronaviruses are important pathogens of humans and animals, and vaccine developments against them are imperative. Due to the ability to induce broad and prolonged protective immunity and the convenient administration routes, live attenuated vaccines (LAVs) are promising arms for controlling the deadly coronavirus infections. However, potential recombination events between vaccine and field strains raise a safety concern for LAVs. The porcine epidemic diarrhea virus (PEDV) remodeled TRS (RMT) mutant generated in this study replicated efficiently in both cell culture and in pigs and retained protective immunogenicity against PEDV challenge in pigs. Furthermore, the RMT PEDV was resistant to recombination and genetically stable. Therefore, RMT PEDV can be further optimized as a backbone for the development of safe LAVs.

PGAM5 degrades PDCoV N protein and activates type I interferon to antagonize viral replication.

IMPORTANCE: As a member of the δ-coronavirus family, porcine deltacoronavirus (PDCoV) is a vital reason for diarrhea in piglets, which can contribute to high morbidity and mortality rates. Initially identified in Hong Kong in 2012, the virus has rapidly spread worldwide. During PDCoV infection, the virus employs evasion mechanisms to evade host surveillance, while the host mounts corresponding responses to impede viral replication. Our research has revealed that PDCoV infection down-regulates the expression of PGAM5 to promote virus replication. In contrast, PGAM5 degrades PDCoV N through autophagy by interacting with the cargo receptor P62 and the E3 ubiquitination ligase STUB1. Additionally, PGAM5 interacts with MyD88 and TRAF3 to activate the IFN signal pathway, resulting in the inhibition of viral replication.

El apoyo de los esposos en sinergia con la distancia al centro de vacunación asociado con el cumplimiento de la vacunación infantil durante la pandemia de COVID-19 en Indonesia / Husbands’ Support Synergistically with Distance to Vaccination Centre Associated with Childhood Immunization Compliance During the COVID-19 Pandemic in Indonesia

Introducción: Durante la pandemia de COVID-19, disminuyó el cumplimiento de la inmunización infantil en Indonesia. Objectivo: Determinar los factores independientes y la relación entre el efecto sinérgico del apoyo de los maridos y la distancia a los centros de vacunación sobre el cumplimiento de la vacunación infantil durante la pandemia. Materiales y Métodos: Un total de 506 madres en la provincia de Jambi, Indonesia, participaron en un estudio transversal desde Marzo hasta Mayo de 2021. Las asociaciones entre los factores se analizaron mediante regresión logística. A partir de las variables más contribuyentes, los investigadores hicieron variables ficticias (2x2) para investigar la asociación sinérgica sobre el cumplimiento de la vacunación infantil del apoyo del marido y la distancia a los centros de vacunación. Resultados: Entre las variables con correlaciones positivas con la vacunación infantil, el apoyo de los esposos y la menor distancia a los centros de vacunación tuvieron un efecto sinérgico en el cumplimiento de la vacunación (AOR IC del 95 % = 4,10 [2–8,41]). Los grupos que recibieron menos apoyo del esposo y la distancia <4 km, así como los grupos que recibieron el apoyo del esposo, pero la distancia > 4 km tuvieron menos cumplimiento (AOR IC del 95 % = 2,47 [1,22–4,97]; 2,83 [1,18–6,81]). Conclusiones: El apoyo familiar y la accesibilidad a la inmunización infantil deben aumentar durante las campañas de vacunación. (AU)

Introduction: During the COVID-19 pandemic, compliance with childhood immunization in Indonesia declined. Objective: To determine the independent factors and the relation between the synergistic effect of husbands’ support and distance to vaccination centres on compliance with childhood immunization during the pandemic. Material and Methods: A total of 506 mothers in Jambi Province, Indonesia, participated in a cross-sectional study from March until May 2021. The associations between the factors were analysed using logistic regression. From the most contributing variables, the researchers made dummy variables (2x2) to investigate the synergistic association on compliance with childhood immunization of husband support and the distance to vaccination centres. Results: Among the variables with positive correlations to childhood vaccination, supportive husbands and less distance to vaccination centres had a synergistic effect on compliance with immunization (AOR 95% CI = 4.10 [2–8.41]). Groups that was less supportive from husband and the distance <4km as well as the groups was husband’s support but the distance >4km had less compliance (AOR 95% CI = 2.47 [1.22–4.97]; 2.83 [1.18–6.81]). Conclusions: Family support and accessibility to childhood immunization should be increased during vaccination campaigns. (AU)

Los sesgos cognitivos en la comunicación provacunas. Un estudio de la página de vacunación de la COVID-19 del Gobierno de España / Cognitive bias in pro-vaccine communication. A study of the COVID-19 vaccination page of the Government of Spain

Fundamentos: La comunicación en salud pretende modificar actitudes y comportamientos, por lo que se vale, entre otros, deestrategias persuasivas y de sesgos cognitivos. Ambos elementos han sido investigados en estudios previos, pero no se han encontrado precedentes de investigaciones que evalúen los mensajes gubernamentales desde ambas perspectivas a la vez. El objetivode esta investigación fue analizar el tipo de información relacionada con la vacunación contra la COVID-19 que se distribuía en lapágina oficial del Gobierno de España, evaluando su capacidad persuasiva y el uso de sesgos cognitivos como herramientas contrala renuencia a la vacunación. Métodos: Se analizó la información de la página oficial sobre vacunación contra la COVID-19 del Gobierno de España, teniendoen cuenta tanto su estructura como el contenido de la información. Se prestó especial atención a la estrategia comunicativa desarrollada para elaborar mensajes provacunas.Resultados: En primer lugar, la información proveniente del Gobierno de España se presentaba de forma concisa, clara y sencillaen una web bien estructurada. En segundo lugar, el contenido compartido giraba en torno a ciertos temas recurrentes como los beneficios y el proceso de la vacunación. En tercer lugar, el contenido poseía un gran carácter científico y se apoyaba en argumentos paraderribar sesgos cognitivos contrarios a la vacunación. Por último, la estrategia comunicativa se basa en contenidos más informativos(racionales) que persuasivos (emocionales). Conclusiones: Conocer las técnicas de persuasión y la implicación de sesgos cognitivos, especialmente en el área de la vacunación, ayudará a orientar las estrategias comunicativas de Salud Pública.(AU)

Background: Health communication aims to modify attitudes and behaviors, which is why it uses, among others, persuasivestrategies and the use of cognitive biases. Both elements have been investigated in previous studies, however, no research precedentshave been found that evaluate government messages from both perspectives at the same time. The objective of this research wasto analyze the type of information related to the COVID-19 vaccination that was distributed on the official page of the Government ofSpain, evaluating its persuasive capacity and the use of cognitive biases as tools against vaccination reluctance. Methods: The information from the official page on vaccination of COVID-19 of the Government of Spain was analysed, taking intoaccount both its structure and the content of the information. Special attention was paid to the communication strategy developed todevelop pro-vaccine messages. Results: First, the information coming from the Government was presented in a concise, clear and simple way on a well-structured webpage. Second, the content shared revolved around certain recurring themes such as the benefits and the vaccination process.Third, the content had a highly scientific nature and was supported by arguments to overthrow cognitive biases against vaccination.Lastly, the communication strategy was based on content that were more informative (rational) than persuasive (emotional). Conclusions: Knowing the techniques of persuasion and the implication of cognitive biases, especially in the area of vaccination, will help guide communication strategies in Public Health.(AU)

Seasonal coronavirus infections trigger NLRP3 inflammasome activation in macrophages but is therapeutically targetable.

Seasonal coronaviruses widely circulate in the global population, and severe complications can occur in specific vulnerable populations. Little is known on their pathogenic mechanisms and no approved treatment is available. Here, we present anecdotal evidence that the level of IL-1ß, a hallmark of inflammasome activation, appears elevated in a subset of seasonal coronavirus infected patients. We found that cultured human macrophages support the full life cycle of three cultivatable seasonal coronaviruses. Their infections effectively activate NLRP3 inflammasome activation through TLR4 ligation and NF-κB activation. This activation can be attenuated by specific pharmacological inhibitors and clinically used medications including dexamethasone and flufenamic acid. Interestingly, combination of antiviral and anti-inflammatory drugs simultaneously inhibit seasonal coronavirus-triggered inflammatory response and viral replication. Collectively, these findings show that the TLR4/NF-κB/NLRP3 axis drives seasonal coronavirus triggered-inflammatory response, which in turn represents a viable therapeutic target.

Convergence insufficiencyCentral mini-plication of medial rectusDiplopiaConsecutive esotropiaSurgical overcorrection / Detection of anti-SARS-CoV-2 antibodies in tears: Ocular surface immunity to COVID-19

Objetivos Evaluar la presencia de anticuerpos IgA e IgG específicos del SARS-CoV-2 en lágrima de sujetos no vacunados y vacunados contra la COVID-19 con antecedentes de infección SARS-CoV-2. Correlacionar los resultados en lágrima con los de saliva y sangre, datos clínicos y regímenes de vacunación. Métodos Estudio transversal que incluyó a sujetos con antecedentes de infección SARS-CoV-2, tanto no vacunados como vacunados contra la COVID-19. Se recogieron 3muestras: lágrima, saliva y sangre. Se analizaron IgA e IgG frente a S-1 SARS-CoV-2 con ELISA semicuantitativo. Resultados Treinta sujetos, con una edad media 36,4±10, varones 13/30 (43,3%) con historia de infección SARS-CoV-2 leve; 13/30 (43,3%) habían recibido un régimen de 2 dosis y 13/30 (43,3%) un régimen de 3 dosis de vacunación anti-COVID-19, 4/30 (13,3%) no estaban vacunados. Todos los sujetos con vacunación completa presentaron IgA detectable en los 3biofluidos. Entre los no vacunados, se detectó IgA en 3/4 sujetos en lágrima y saliva, mientras que no se detectó IgG. No se observaron diferencias entre la pauta de vacunación de 2 y 3 dosis según los títulos IgA-IgG. Conclusiones Anticuerpos IgA e IgG del SARS-CoV-2 están presentes en lágrimas de pacientes con antecedentes de COVID-19 leve, lo que destaca el papel de la superficie ocular como primera línea de defensa frente a la infección. La mayoría de los sujetos no vacunados presentaron IgA a largo plazo en lágrima y saliva. La inmunización híbrida (infección natural más vacunación) parece potenciar las respuestas IgG mucosas y sistémicas. No se observaron diferencias entre la pauta de 2 y 3 dosis (AU)

Purpose To evaluate the presence of SARS-CoV-2 specific IgA and IgG antibodies in tears of unvaccinated and anti-COVID-19 vaccinated subjects with previous history of SARS-CoV-2 infection. To compare results in tears with those in saliva and serum and correlate with clinical data and vaccination regimens. Methods Cross-sectional study including subjects with a previous history of SARS-CoV-2 infection, both unvaccinated and vaccinated against COVID-19. Three samples were collected: tears, saliva and serum. IgA and IgG antibodies against S-1 protein of SARS-CoV-2 were analyzed with a semi-quantitative ELISA. Results Thirty subjects, mean age 36.4±10, males 13/30 (43.3%) with history of mild SARS-CoV-2 infection were included. 13/30 (43.3%) subjects had received a 2-dose regimen and 13/30 (43.3%) a 3-dose regimen of anti-COVID-19 vaccine, 4/30 (13.3%) subjects were unvaccinated. All the participants with full anti-COVID-19 vaccination (2-or 3-doses) presented detectable anti-S1 specific IgA in all 3biofluids, tears, saliva and serum. Among unvaccinated subjects, specific IgA was detected in 3/4 subjects in tears and saliva, whereas IgG was not detected. Considering IgA and IgG antibodies titers, no differences were observed between the 2- and 3-dose vaccination regimen. Conclusions SARS-CoV-2-specific IgA and IgG antibodies were detected in tears after mild COVID-19, highlighting the role of the ocular surface as a first line of defense against infection. Most naturally infected unvaccinated individuals exhibit long-term specific IgA in tears and saliva. Hybrid immunization (natural infection plus vaccination) appears to enhance mucosal and systemic IgG responses. However, no differences were observed between the 2- and 3-dose vaccination schedule (AU)

Anticuerpos contra el SARS-CoV-2 tras la dosis de vacuna de recuerdo. Identificación de subgrupos con respuesta insuficiente / SARS-CoV-2 antibodies after booster vaccination. Identification of subgroups with poor response

Objetivo Identificar dentro del grupo de pacientes de alto riesgo a aquellos que presentan más posibilidad de presentar inmunidad postvacunal insuficiente. Método Determinación de títulos de IgG frente a SARS-CoV-2 después de la dosis de recuerdo. Se clasificó la respuesta vacunal como negativa (títulos IgG <34 BAU/ml), indeterminada (títulos 34 - 259 BAU/ml) o positiva (≥260 BAU/ml). Resultados Se incluyeron 765 pacientes (31,25% de los vacunados): 54 (7,1%) en tratamiento con fármacos biológicos, 90 (11,8%) con enfermedad hematológica, 299 (39,1%) con patología oncológica, 304 (39,7%) con trasplante de órgano sólido y 18 (2,4%) con inmunosupresión por otros motivos. Un total de 74 pacientes (9,7%) tuvieron una serología negativa y 45 (5,9%) obtuvieron títulos indeterminados. Por grupo diagnóstico, los pacientes con mayor porcentaje de serología negativa o indeterminada fueron pacientes bajo tratamiento con fármacos biológicos (55,6%, fundamentalmente a expensas de antiCD20), hematológicos (35,4%) y los trasplantados (17,8%, principalmente pulmón y riñón). Los pacientes oncológicos y otros pacientes inmunosuprimidos tuvieron buena respuesta vacunal. Conclusión Los pacientes tratados con fármacos antiCD20, los hematológicos y los trasplantados (fundamentalmente de pulmón y riñón) presentaron mayor riesgo de no desarrollar inmunidad postvacunal. Es fundamental su identificación de cara a individualizar y mejorar su manejo (AU)

Objective To determine which patients within the high-risk group are most likely to have insufficient post-vaccination immunity. Methods Determination of IgG titers against SARS-CoV-2 after the booster dose. Vaccine response was categorized as negative (IgG titers <34 BAU/ml), indeterminate (titers 34 - 259 BAU/ml) or positive (≥ 260 BAU/ml). Results 765 patients were included (31.25% of those vaccinated). 54 (7.1%) on treatment with biologics, 90 (11.8%) with hematologic disease, 299 (39.1%) with oncologic pathology, 304 (39.7%) with solid organ transplant and 18 (2.4%) with immunosuppression for other reasons. 74 patients (9.7%) had negative serology and 45 (5.9%) had indeterminate titers. By diagnostic group, the patients with the highest proportion of negative or indeterminate serology were patients with biologic treatment (55.6%, mainly at expense of antiCD20), hematologic (35.4%) and transplant patients (17.8%, mainly lung and kidney). Oncology and other immunosuppressed patients had a favorable response to vaccination. Conclusion Patients treated with antiCD20 drugs, hematologic patients and transplanted patients (mainly lung and kidney) have a higher risk of not achieving post-vaccination immunity. It is essential to identify them in order to individualize and optimize their management (AU)

Estrategia de vacunación frente a COVID-19 del ISPLN / Vaccination strategy against COVID-19 of the ISPLN

La Estrategia de vacunación frente a la COVID ha sido el primer programa de vacunación queha implicado prácticamente a toda la población, por ello ha supuesto un esfuerzo muy impor-tante para el Ministerio de Sanidad en coordinación con las CCAA. También en Navarra ha sidonecesario coordinar todas las fases tanto de planificación como de operativización.En este artículo se introduce la gobernanza del programa de vacunación, se describe el pro-ceso de recepción de la vacuna en el Instituto de Salud Pública y Laboral de Navarra (ISPLN),el mantenimiento de la cadena del frío y la preparación para la distribución a los puntos deadministración y las coberturas de vacunación alcanzadas. A 30 de octubre de 2022, se habían recibido 1.406.169 dosis de vacunas. El 86,5% de la pobla-ción había recibido una dosis de vacuna, el 85,8% la pauta completa de primovacunación yel 56,6% una dosis de refuerzo (>95% de los mayores de 60 años). A 22 de febrero de 2023, enNavarra han recibido la segunda dosis de recuerdo de la vacuna el 86,3% de las personas de 80y más años, el 75,8% de las de 70 a 79 años y el 57,7% de las de 60 a 69 años, frente al 76,1%, el66,2% y el 46,8%, respectivamente, en el conjunto del estado. El éxito de este programa de vacunación se debe a la implicación de la organización y delpersonal que ha participado en cada eslabón del proceso, a haber mantenido una estrategiacomún y unos criterios similares en todas las CCAA, a haber monitorizado continuamente lascoberturas alcanzadas en los distintos grupos de población y a la adherencia de la poblaciónnavarra, que tiene impregnada la cultura de la prevención mediante la vacunación.(AU)

Plan operativo de la Atención Primaria para la vacunación poblacional frente a COVID-19 / Operational Plan of Primary Care for population vaccination against COVID-19

La pandemia de COVID-19 ha supuesto enormes costes humanos y económicos en España y anivel mundial. Disponer a corto plazo de una o varias vacunas eficaces y seguras, que puedanutilizarse en una estrategia poblacional, es fundamental para reducir el impacto de la pande-mia y restablecer el normal funcionamiento de nuestra sociedad. La estrategia de vacunaciónpara España tiene como objetivo reducir la morbimortalidad por COVID-19, teniendo en cuen-ta la limitada disponibilidad inicial de vacunas y la evolución continua del conocimiento sobreaspectos fundamentales de esta enfermedad. En Navarra, la campaña de vacunación frente a COVID-19 comenzó el domingo 27 de diciembredel 2020 en la Residencia El Vergel, a la que siguieron de forma progresiva el resto de centrossociosanitarios públicos y privados hasta alcanzar, entre enero y febrero del 2021, a las 13.000personas que componen la población de residentes de estos espacios y los profesionales delos mismos, primer grupo marcado como prioritario en el cronograma establecido entre elMinisterio de Sanidad y las comunidades autónomas. La previsión del Departamento de Salud, dentro de una coordinación estatal y en función dela disponibilidad de las vacunas que fueron asignadas y remitidas a la comunidad foral, eraalcanzar la población diana que se fue estableciendo en las recomendaciones de las actualiza-ciones de la Estrategia de Vacunación frente a COVID-19 en España.(AU)

Impacto de la vacunación frente a la COVID-19 en Navarra, 2021-2022 / Impact of vaccination against COVID-19 in Navarre, 2021-2022

Fundamento: La COVID-19 tuvo un impacto importante en la salud de la población. Desdeenero de 2021, una proporción creciente de la población ha recibido vacunas frente a laCOVID-19 (vacunación COVID) que han demostrado una alta efectividad para prevenir formasgraves de esta enfermedad. Este estudio ha evaluado el impacto de la vacunación COVID paraprevenir hospitalizaciones y defunciones en Navarra. Métodos: A partir de la vigilancia epidemiológica reforzada y de estimaciones de efectividadde las vacunas se calculó el número de infecciones, ingresos hospitalarios y en unidades decuidados intensivos (UCI) y defunciones que se han prevenido mediante la vacunación COVID entre enero de 2021 y septiembre de 2022. Resultados. Hasta septiembre de 2022, el 88% de la población había recibido alguna dosisde vacuna COVID. Se estima que la vacunación ha prevenido el 15% (n=45.320) de los casosconfirmados, el 75% (n=12.703) de los ingresos hospitalarios, el 66% (n=877) de los ingresosen UCI y el 82% (n=3.367) de las defunciones. Durante 2021 descendió progresivamente laproporción de ingresos y defunciones por COVID-19 observados respecto a las que hubieranpodido producirse sin vacunación. En ausencia de vacunación COVID, los ingresos y defuncionesen las ondas de la variante Ómicron habrían superado ampliamente las cifras registradas en2020. Se estima que se evitó un caso de COVID-19 confirmado por cada 13 personas vacunadas,una hospitalización por cada 45, un ingreso en UCI por cada 656 y una defunción por cada 171. Conclusiones: La vacunación COVID ha tenido un papel muy importante en la prevención dehospitalizaciones y defunciones en Navarra, cambiando totalmente la gravedad y letalidad deesta enfermedad.(AU)

Infección, hospitalización y mortalidad por COVID-19 en Navarra, febrero de 2020 a septiembre de 2022 / Infection, hospitalization and mortality from COVID-19 in Navarra, February 2020 to September 2022

Fundamento. El SARS-CoV-2 ha circulado ininterrumpidamente en España desde febrero de 2020 hasta septiembre de 2022. El presente estudio estima y describe su repercusión en infecciones, hospitalizaciones y defunciones. Métodos. A partir de la vigilancia epidemiológica reforzada, los resultados de encuestas seroepidemiológicas y los datos de mortalidad diaria, se han analizado las infecciones, hospitalizaciones y defunciones por COVID-19 entre febrero de 2020 y septiembre de 2022 en Navarra. Resultados. Se confirmaron 295.424 personas con COVID-19 (45% de la población), 8594 requirieron ingreso hospitalario (1,3% habitantes), 832 ingresaron en unidades de cuidados intensivos (UCI) (1,3 por 1000) y 1725 fallecieron (2,6 por 1000). La primera onda pandémica produjo 1934 hospitalizaciones y 529 defunciones por COVID-19 confirmado en pocas semanas, y su número descendió rápidamente tras el confinamiento domiciliario. Hasta octubre de 2021 la circulación del SARS-CoV-2 estuvo modulada por las medidas preventivas no farmacológicas. La extensión de la vacunación frente a la COVID-19 introdujo cambios decisivos en la epidemiología de la enfermedad, reduciendo a menos del 2% los casos que requerían hospitalización, del 0,1% los que ingresaban en UCI y del 0,5% la letalidad. Conclusiones. Coincidiendo con la generalización de la vacunación se produjo una reducción importante de la gravedad y letalidad de la COVID-19, que pasó de comportarse inicialmente como una pandemia, a acabar asemejándose a otras infecciones endémicas por virus respiratorios. El confinamiento domiciliario inicial, las medidas preventivas no farmacológicas y la vacunación de la COVID-19 han sido intervenciones eficaces y oportunas para reconducir el curso de la pandemia en diferentes momentos.(AU)

Role of vaccination and anti-SARS-CoV-2 antibodies in the clinical outcome of hospitalized COVID-19 patients / Papel de la vacunación y los anticuerpos anti-SARS-CoV-2 en el desenlace clínico de pacientes hospitalizados por COVID-19

Background Although vaccination has considerably reduced the risk of hospitalization and death from COVID19, the impact of vaccination and anti-SARS-CoV-2 antibody status on the outcome of patients who required hospitalization has been poorly investigated. Material and methods A prospective observational study in 232 patients hospitalized for COVID19 was carried out from October 2021 to January 2022 to evaluate the role on patient outcome of their vaccination and anti-SARS-CoV-2 antibody status and titer, comorbidities, analytical determinations, clinical presentation at admission, treatments and requirements for respiratory support. Cox regression and survival analyzes were performed. The SPSS and “R” programs were used. Results Patients with complete vaccination schedule had higher S-protein antibody titers (log10 3.73 [2.83–4.6]UI/ml vs 1.6 [2.99–2.61]UI/ml; p<0.001), lower probability of radiographic worsening (21.6% vs. 35.4%; p=0.005), less likely required high doses of dexamethasone (28.4% vs. 45.4%; p=0.012), high-flow oxygen (20.6% vs. 35.4%; p=0.02), ventilation (13.7% vs, 33.8%; p=0.001) and intensive care admissions (10.8% vs. 32.6%; p<0.001). Remdesivir (HR=0.38; p<0.001) and complete vaccination schedule (HR=0.34; p=0.008) were protective factors. No differences in antibody status were detected between groups (HR=0.58; p=0.219). Conclusions SARS-CoV-2 vaccination was associated with higher S-protein antibody titers and lower probability of radiological progression, immunomodulators requirement and respiratory support or death. However, vaccination but not antibody titters protected from adverse events pointing a role of immune-protective mechanisms in addition to humoral response (AU)

Antecedentes Aunque la vacunación ha reducido considerablemente el riesgo de hospitalización y muerte por COVID-19, se ha investigado poco el impacto de la vacunación y el estado de los anticuerpos anti-SARS-CoV-2 en la evolución de los pacientes que requieren hospitalización. Material y métodos Se realizó un estudio observacional prospectivo en 232 pacientes hospitalizados por COVID-19 desde octubre del 2021 hasta enero del 2022 para evaluar el impacto en la evolución clínica del estado vacunal, el título de anticuerpos anti-SARS-CoV-2, la presencia de comorbilidades, analítica, la clínica al ingreso, tratamientos y soporte respiratorio. Se realizaron análisis de supervivencia y regresión de Cox. Se utilizaron los programas SPSS y «R». Resultados Los pacientes con esquema de vacunación completo presentaron títulos de anticuerpos contra la proteína S más elevados (log10 3,73 [2,83-4,6] UI/mL vs. 1,6 [2,99-2,61] UI/mL; p < 0,001), menor probabilidad de empeoramiento radiográfico (21,6 vs. 35,4%; p = 0,005), requirieron con menor probabilidad dosis elevadas de dexametasona (28,4 vs. 45,4%; p = 0,012), oxígeno de alto flujo (20,6 vs. 35,4%; p = 0,02), ventilación (13,7 vs. 33,8%; p = 0,001) e ingresos en cuidados intensivos (10,8 vs. 32,6%; p < 0,001). El remdesivir (HR = 0,38; p < 0,001) y el esquema completo de vacunación (HR = 0,34; p = 0,008) fueron factores protectores de mala evolución. No se detectaron diferencias en el estado de los anticuerpos entre los grupos (HR = 0,58; p = 0,219). Conclusiones La vacunación contra el SARS-CoV-2 se asoció con mayores títulos de anticuerpos contra la proteína S y menor probabilidad de progresión radiológica, requerimiento de inmunomoduladores y soporte respiratorio o muerte. Sin embargo, la vacunación, pero no los títulos de anticuerpos, protegió de los eventos adversos, lo que indica un papel de los mecanismos de protección inmunológica además de la respuesta humoral (AU)

MERS-CoV‒Specific T-Cell Responses in Camels after Single MVA-MERS-S Vaccination.

We developed an ELISPOT assay for evaluating Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV)‒specific T-cell responses in dromedary camels. After single modified vaccinia virus Ankara-MERS-S vaccination, seropositive camels showed increased levels of MERS-CoV‒specific T cells and antibodies, indicating suitability of camel vaccinations in disease-endemic areas as a promising approach to control infection.

Heterogeneous Nuclear Protein U Degraded the m6A Methylated TRAF3 Transcript by YTHDF2 To Promote Porcine Epidemic Diarrhea Virus Replication.

Porcine epidemic diarrhea virus (PEDV) belongs to the genus Alphacoronavirus of the Coronaviridae family and can cause fatal watery diarrhea in piglets, causing significant economic losses. Heterogeneous nuclear protein U (HNRNPU) is a novel RNA sensor involved in sensing viral RNA in the nucleus and mediating antiviral immunity. However, it remains elusive whether and how cytoplasmic PEDV can be sensed by the RNA sensor HNRNPU. In this study we determined that HNRNPU was the binding partner of Nsp13 by immunoprecipitation-liquid chromatography-tandem mass spectrometry (IP/LC-MS/MS) analysis. The interaction between Nsp13 and HNRNPU was demonstrated by using coimmunoprecipitation and confocal immunofluorescence. Next, we identified that HNRNPU expression is significantly increased during PEDV infection, whereas the transcription factor hepatocyte nuclear factor 1α (HNF1A) could negatively regulate HNRNPU expression. HNRNPU was retained in the cytoplasm by interaction with PEDV Nsp13. We found that HNRNPU overexpression effectively facilitated PEDV replication, while knockdown of HNRNPU impaired viral replication, suggesting a promoting function of HNRNPU to PEDV infection. Additionally, HNRNPU was found to promote PEDV replication by affecting TRAF3 degradation at the transcriptional level to inhibit PEDV-induced beta interferon (IFN-ß) production. Mechanistically, HNRNPU downregulates TRAF3 mRNA levels via the METTL3-METTL14/YTHDF2 axis and regulates immune responses through YTHDF2-dependent mRNA decay. Together, our findings reveal that HNRNPU serves as a negative regulator of innate immunity by degrading TRAF3 mRNA in a YTHDF2-dependent manner and consequently facilitating PEDV propagation. Our findings provide new insights into the immune escape of PEDV. IMPORTANCE PEDV, a highly infectious enteric coronavirus, has spread rapidly worldwide and caused severe economic losses. During virus infection, the host regulates innate immunity to inhibit virus infection. However, PEDV has evolved a variety of different strategies to suppress host IFN-mediated antiviral responses. Here, we identified that HNRNPU interacted with viral protein Nsp13. HNRNPU protein expression was upregulated, and the transcription factor HNF1A could negatively regulate HNRNPU expression during PEDV infection. HNRNPU also downregulated TRAF3 mRNA through the METTL3-METTL14/YTHDF2 axis to inhibit the production of IFN-ß and downstream antiviral genes in PEDV-infected cells, thereby promoting viral replication. Our findings reveal a new mechanism with which PEDV suppresses the host antiviral response.